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Ultracentrifugação é um procedimento comum em microbiologia e consiste na centrifugação a uma velocidade muito elevada, através de uma ultracentrifugadora que pode atingir 150 000 rpm (rotações por minuto), gerando campos de centrifugação de mais de 1 milhão X g. O processo é utilizado para na determinação do peso molecular e tamanho de proteínas, ácidos nucleicos e partículas subcelulares (a nível de organelas) através do fracionamento/separação destas moléculas.